Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms