Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms