Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms