Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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