Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMP1P11279 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms