Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms