Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPRP00739 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPRP00739 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPRP00739 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HPRP00739 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms