Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPBO95292 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPBO95292 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms