Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms