Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF2O60811 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms