Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPLO60437 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPLO60437 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPLO60437 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms