Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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