Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms