Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms