Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLXND1Q9Y4D7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms