Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms