Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms