Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms