Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms