Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCDHA12Q9UN75 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms