Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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