Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms