Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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