Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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