Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms