Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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