Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBRD1Q9NUN5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms