Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms