Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOJQ9H4E5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms