Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms