Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD60Q9BZ19 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms