Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRXQ9BXM0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRXQ9BXM0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms