Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARD11Q9BXL7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms