Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms