Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms