Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms