Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NDFIP1Q9BT67 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms