Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms