Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms