Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms