Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms