Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF501Q96CX3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms