Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms