Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms