Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms