Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms