Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms