Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNIP2Q8NFZ5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms