Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TTC21AQ8NDW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC21AQ8NDW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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