Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms